實驗室的“三廢”主要指廢液、廢氣、廢水。廢液是指廢棄的有機溶劑等，廢氣是指有機化合物的蒸汽、酸氣等。實驗室污水含有各種化學物質(zhì)，未經(jīng)處理直接排入下水管道會造成周圍環(huán)境的污染，這樣不僅對人體有害，而且還會給附近地區(qū)的工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和養(yǎng)魚業(yè)造成很大損失。

實驗室建設設計考慮建立廢水處理系統(tǒng)、有機溶劑回收系統(tǒng)、廢氣無害化處理系統(tǒng)。由處理系統(tǒng)先將含有不同無機物的廢水進行分類沉降，過濾除去絕大部分無機物，再進行氧化吸附等無害化處理。處理系統(tǒng)還要能對不同種類的有機溶劑進行分餾，回收再利用，無再利用價值的廢液再進行氧化處理。為防止廢氣污染環(huán)境，應在廢氣排放口采用相應的凈化措施。例如：在通風系統(tǒng)的末端，利用先進的納米半導體光催化及臭氧氧化技術將廢氣凈化處理。